新型コロナウイルス　その５０　ヒトゲノム

　染色体は遺伝情報の発現と伝達をする生体物質です。塩基性の色素でよく染色されることから、１８８８年、ヴィルヘルム・フォン・ヴァルデヤーによって、Ｃｈｒｏｍｏｚｏｍｅと名付けられました。ある生物の染色体を調べたい時、コルヒチン等の薬剤で細胞を処理し細胞をＭ期で停止させてからギムザ染色を施し、凝縮した染色体の数と形状を観察します。こうして撮影された染色体を並べたものが、核型＝カプリオタイプです。これを分析して、分類学的検討を行うことを核型分析と言います。カプリオタイプは種ごとに一定で、ヒトは２２対の常染色体と１対の性染色体、計４６本の染色体をもっています。女性は２本のＸ染色体、男性ではＸ染色体とＹ染色体を１本ずつ持っています。「新型コロナウイルス　その１５　内在性ウイルス」にも書きましたが、ヒトゲノムの約８％はウイルス由来です。特にレトロウイルスは1億６０００万年前に「ＰＥＧ１０」という遺伝子を哺乳類の祖先に持ち込み、胎盤ができるようになりました。話は変わりますが、感染研のＰＣＲマニュアルはＮｅｓｔｅｄＰＣＲで新型コロナウイルスの遺伝子の一番端の部分、スパイクタンパクの２０塩基を使用し、増幅しています。これを並べると、ＧＡＧＧＡＡＣＧＡＧＡＡＧＡＧＧＣＴＴＧですが、最初の１６塩基がヒトの第８染色体のＧＡＧＧＡＡＣＧＡＧＡＡＧＡＧＧと一致しています。カプシド領域を使うと、ＣＡＣＡＴＴＧＧＣＡＣＣＣＧＣＡＡＴＣとなりますが、最後の１６塩基がヒトの第１０染色体、ＡＴＴＧＧＣＡＣＣＣＧＣＡＡＴＣと一致します。一般に行われているリアルタイムＰＣＲは真ん中の部分とカプシド領域のＣＴＣＣＣＴＴＴＧＴＴＧＴＧＴＴＧＴを使いますが、最後の１６塩基、ＣＣＣＴＴＴＧＴＴＧＴＧＴＴＧＴが、ヒトの第１１染色体の塩基と一致します。また、最後の１５塩基、ＣＣＴＴＴＧＴＴＧＴＧＴＴＧＴが、ヒトの第６染色体の塩基と一致します。ＰＣＲはもともと遺伝子塩基の一部を切り取って増幅する検査です。増幅する塩基の数はせいぜい２０個程度で、これを双方向に並べてプライマーとし、数百万倍に増やします。たまたま、４０サイクル回したところで、ヒトの染色体と一致する部分が現れるとＰＣＲ陽性になります。こういったことは当然避けなければなりませんが、新型コロナウイルス遺伝子のどこの部分の塩基を切り取ってきてプライマーとして使うかは、各国、各検査会社によって違います。検査技師が２０サイクル回して、同じような遺伝子が見つかれば、そこで陽性と判断します。要は陽性となるまで回せばいいわけで、その中にヒトの遺伝子と相同性のある塩基配列が見つかれば、これも陽性と判断されます。先日、埼玉の劇団員の一人がスマホの接触アプリ「ＣＯＣＯＡ」を見ていました。症状は何もありませんでしたが、ＰＣＲ陽性者と濃厚接触が疑われたため検査に行き、そこで陽性と診断されました。稽古場にいた９０人も検査を受けました。そのうち６２人の感染が確認されました。ほとんど全員が無症状ということです。ＰＣＲには落とし穴がたくさんあります。ＰＣＲで陽性になる人の９５％は無症状です。そもそも武漢で発生したウイルスはすでに変異を繰り返し、変異率はクルーズ船がやってきた時点ですでに２％、緊急事態宣言が出された４月で5％を超えています。この後、急速に検出率は低下します。１０カ月が経過し、ＰＣＲで検出することは１００％不可能に近いと思われます。もはやＰＣＲが何の遺伝子を検出しているかわかりません。国や自治体は積極的にＰＣＲ陽性者をあぶりだし、隔離しようとしています。全く無駄な出費です。検査技師が、陽性反応が出るまで４０回も回せば、もしかしたら、「ヒトゲノム」を検出している可能性も否定できません。繰り返しになりますが、ＰＣＲは感染症の診断には不向きです。

２０２０．１０．１１．　氷川台内科クリニック　院長　櫻田　二友